2006年，在全國范圍取消農業(yè)稅。通過試點、總結經驗，積極穩(wěn)妥地推進鄉(xiāng)鎮(zhèn)機構改革，切實轉變鄉(xiāng)鎮(zhèn)政府職能，創(chuàng)新鄉(xiāng)鎮(zhèn)事業(yè)站所運行機制，精簡機構和人員，5年內鄉(xiāng)鎮(zhèn)機構編制只減不增。妥善安置分流人員，確保社會穩(wěn)定。要按照強化公共服務、嚴格依法辦事和提高行政效率的要求，認真解決機構和人員臃腫的問題，切實加強政府社會管理和公共服務的職能。加快農村義務教育體制改革，建立和完善各級政府責任明確、財政分級投入、經費穩(wěn)定增長、管理以縣為主的農村義務教育管理體制，中央和省級政府要更多地承擔發(fā)展農村義務教育的責任，深化農村學校人事和財務等制度改革。有條件的地方可加快推進“省直管縣”財政管理體制和“鄉(xiāng)財縣管鄉(xiāng)用”財政管理方式的改革。各地要對鄉(xiāng)村債務進行清理核實，2006年選擇部分縣(市)開展化解鄉(xiāng)村債務試點工作，妥善處理歷年農業(yè)稅尾欠，完善涉農稅收優(yōu)惠方式，確保農民直接受益。深化國有農場稅費改革，將農業(yè)職工土地承包費中類似農村“鄉(xiāng)鎮(zhèn)五項統籌”的費用全部減除，農場由此減少的收入由中央和省級財政給予適當補助。國有農場要逐步剝離辦社會的職能，轉變經營機制，在現代農業(yè)建設中發(fā)揮示范作用。

鞏固和發(fā)展農村信用社改革試點成果，進一步完善治理結構和運行機制。縣域內各金融機構在保證資金安全的前提下，將一定比例的新增存款投放當地，支持農業(yè)和農村經濟發(fā)展，有關部門要抓緊制定管理辦法。擴大郵政儲蓄資金的自主運用范圍，引導郵政儲蓄資金返還農村。調整農業(yè)發(fā)展銀行職能定位，拓寬業(yè)務范圍和資金來源。國家開發(fā)銀行要支持農村基礎設施建設和農業(yè)資源開發(fā)。繼續(xù)發(fā)揮農業(yè)銀行支持農業(yè)和農村經濟發(fā)展的作用。在保證資本金充足、嚴格金融監(jiān)管和建立合理有效的退出機制的前提下，鼓勵在縣域內設立多種所有制的社區(qū)金融機構，允許私有資本、外資等參股。大力培育由自然人、企業(yè)法人或社團法人發(fā)起的小額貸款組織，有關部門要抓緊制定管理辦法。引導農戶發(fā)展資金互助組織。規(guī)范民間借貸。穩(wěn)步推進農業(yè)政策性保險試點工作，加快發(fā)展多種形式、多種渠道的農業(yè)保險。各地可通過建立擔?；鸹驌C構等辦法，解決農戶和農村中小企業(yè)貸款抵押擔保難問題，有條件的地方政府可給予適當扶持。

穩(wěn)定和完善以家庭承包經營為基礎、統分結合的雙層經營體制，健全在依法、自愿、有償基礎上的土地承包經營權流轉機制，有條件的地方可發(fā)展多種形式的適度規(guī)模經營。加快集體林權制度改革，促進林業(yè)健康發(fā)展。完善糧食流通體制，深化國有糧食企業(yè)改革，建立產銷區(qū)穩(wěn)定的購銷關系，加強國家對糧食市場的宏觀調控。加快征地制度改革步伐，按照縮小征地范圍、完善補償辦法、拓展安置途徑、規(guī)范征地程序的要求，進一步探索改革經驗。完善對被征地農民的合理補償機制，加強對被征地農民的就業(yè)培訓，拓寬就業(yè)安置渠道，健全對被征地農民的社會保障。推進小型農田水利設施產權制度改革。